Planira, koordinira i prati usklađivanje pravnog sistema BiH sa pravnim propisima Evropske unije, analizira usklađenost prijedloga propisa sa propisima Evropske unije, s obavezama preuzetim SSP-om, izrađuje mišljenja o usklađenosti prijedloga propisa u sljedećim oblastima:

-         sloboda protoka roba

-         pravo intelektualnog vlasništva

-         slobodno kretanje radne snage

-         pravo poslovnog nastanjenja i sloboda pružanja usluga

-         finansijske usluge

-         slobodan protok kapitala

-         pravo privrednih društava

-         konkurencija

-         javne nabavke

-         porezi

-         statistika

-         socijalna politika i zapošljavanje

-         informirano društvo i mediji

-         zaštita zdravlja i zaštita potrošača

-         carinska unija

-         finansijska kontrola i

-         finansijske odredbe i budžet.

Odsjek učestvuje u koordinaciji i pripremi i izradi Programa pridruživanja Bosne i Hercegovine Evropskoj uniji (PPEU), učestvuje u nadzoru njegove provedbe, ažuriranju i izvještavanju.